近日,王颖教授课题组在化学信息学领域知名期刊《Journal of Chemical Information and Modeling》上发表了题为“Identification of a Novel Core Structure of Apo-IDO1 Inhibitors Through Virtual Screening and Preliminary Hit Optimization”的研究论文。该论文第一作者为硕士研究生尹业奎(现为中山大学-深圳理工大学联合培养博士生),王颖教授与刘中华教授为通讯作者。

该研究围绕肿瘤免疫治疗的关键靶点IDO1(Indoleamine 2,3-dioxygenase 1)展开。针对传统IDO1抑制剂临床转化不理想的困境,团队聚焦于更具潜力的新型apo-IDO1抑制剂。研究中,团队设计并验证了一套整合分子对接和元动力学模拟的虚拟筛选流程,并成功鉴定出具有全新化学骨架的先导分子 MQ-1 (IC50 = 1.29 μM)。为实现高效的结构优化,团队通过构建自由能景观和自组织神经网络等方法阐明了化合物与靶点的作用机制,对 MQ-1 的结构和构效关系(SAR)提供了理论依据,并最终获得活性提升数倍的优化分子 MQ-1n (IC50 = 0.29 μM)。
这项研究所建立的计算驱动的药物发现范式,为攻克IDO1及其他挑战性靶点提供了宝贵借鉴;同时,所发现的全新apo-IDO1抑制剂骨架也为后续抗肿瘤药物的研发提供了良好起点。

第一作者:尹业奎